商標轉讓合同是商標轉讓不可或缺的一部分，不可避免地會產生合同問題的糾紛。那么當我們遇到商標轉讓合同糾紛時，該怎么辦呢？
商標轉讓合同糾紛有以下幾種解決方式：
1.如果是企業(yè)內部問題導致的糾紛，則屬于民事法律糾紛范疇，當事人自身需要通過司法訴訟來維護自身權益。
民事調解達成的協(xié)議不具有法律強制力，但仲裁調解或訴訟調解達成的協(xié)議在依法作出的法律文書生效后具有強制力，當事人必須履行協(xié)議內容。
2.如果商標轉讓申請正在商標局的轉讓審查過程中，商標局會給當事人一個合理的處理期限。
商標合同糾紛的調解沒有法定程序，但商標合同糾紛的仲裁或訴訟必須嚴格按照仲裁法和民事訴訟法規(guī)定的程序進行，否則就是程序違法。
3.如果商標糾紛涉及法定權限，當事人只能通過向法院申請證據(jù)保全措施，暫時凍結商標轉讓后權利的執(zhí)行，最終通過訴訟程序解決糾紛。
4.如果商標是非法轉讓的，比如假冒、偽造，需要當?shù)毓膊块T做刑事鑒定，然后走司法程序。
5.對屬于商標局作出的“不予受理”、“不予核準”等行政決定的行政爭議，當事人可以通過國家工商行政管理總局或者行政訴訟解決。
仲裁機構對商標爭議的仲裁裁決是終局的，具有法律效力。當事人不自覺履行的，對方當事人可以申請有關人民法院強制執(zhí)行。
商標爭議經人民法院依法審理并作出民事判決后，當事人可以在法定期限內向上級法院提起上訴，二審為終審。生效的民事判決具有強制執(zhí)行效力，當事人應當自覺履行。如果他們不履行，法院可以根據(jù)一方當事人的申請或依職權采取措施，迫使有關當事人履行判決的內容。